El actual Museo Nacional de Cartago fue fundado en 1875 por el Cardenal Lavigerie como Museo de San Luis en la sede del Monasterio de los Padres Blancos (Sociedad de los Misioneros de África), en la colina de Byrsa.
En 1956 recibió su actual nombre.
Con ese primer nombre fueron presentadas estas treinta y cinco fotografías en la Exposición de Madrid de 1892, agrupadas en tres cuadros en cuyas imágenes aparecían objetos púnicos, romanos y cristianos de dicho museo y tres vistas de sus salas, con estanterías y vitrinas repletas de objetos.
Sus ricas colecciones, entre las que destacan las púnicas, proceden de las excavaciones europeas iniciadas en el XIX, destacando las del Padre Alfred Louis Delattre.Salto de línea